- Centro de biotecnología vegetal
- Centro de investigaciones biomédicas
- Centro de Investigaciones Quintay
- Centro de Sustentabilidad
- Departamento de Ecología y biodiversidad
- Departamento de Ciencias Físicas
- Departamento de Ciencias Químicas
- Departamento de Ciencias de la Ingeniería
- Departamento de Ciencias Biológicas
Departamento de Matemáticas - Núcleo Milenio en Genómica Funcional de Plantas
- Núcleo Milenio de Estudios de Supernovas
- Núcleo Milenio de Ingeniería Molecular y Química Supramolecular para Catálisis, Electrocatálisis, Remediación y Conversión de Energía
- Instituto Milenio de Inmunología e inmunoterapia
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